На примере основных природных комплексов Южного Урала показано, что эффективное управление плодородием почв возможно только в рамках агроэкосистемного подхода при оптимизации соотношения и усиления связей между всеми компонентами агроэкосистемы: почвами, естественными кормовыми угодьями, скотом и лесом. Система управления позволяет решать задачи энергосбережения и ресурсосбережения в рамках основных концепций современной агроэкологии. Обосновывается важная роль промежуточных культур в более полном использовании биоклиматических ресурсов, получении дополнительной с.-х. продукции и благотворном влиянии на плодородие почвы. Более широкая практика возделывания поликультур дает возможность уменьшить колебания в продуктивности в годы с разными погодными условиями, улучшить фитосанитарное состояние посевов, сохранять потенциальное плодородие почв.